Mit Konfigurationsvariablen lässt sich das Verhalten von Professional ERP an vielen Stellen individuell anpassen. Dies ist über die Maske Konfigurationsvariablen unter Firmendaten möglich. Über die Suchfunktion lassen sich Konfigurationsvariablen über deren Namen, deren Funktion oder über das Programm in welchem diese sich auswirken suchen. Wählt man eine Konfigurationsvariable findet man unter Funktion eine Dokumentation zu der Konfigurationsvariable. Über die Schaltfläche "Neu" ist es möglich einen neuen Wert hinzufügen. Ein geänderter Wert wirkt sich erst nach Neustart der Maske aus.